中国生物制品学杂志

2020, v.33(03) 266-270

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赤子爱胜蚓蛋白磷酸酶2A类似激活剂样蛋白cDNA和氨基酸序列分析
The cDNA and amino acid sequence analysis of protein phosphatase 2A activator-like protein from Eisenia foetida

马培元;于保锋;王萱;张丽娜;田九博;穆秀丽;孟涛涛;弓韬;

摘要(Abstract):

目的分析赤子爱胜蚓蛋白磷酸酶2A(protein phosphatase 2A,PP2A)类似激活剂样蛋白的cDNA和氨基酸序列。方法从赤子爱胜蚓cDNA文库中随机测序得到目标cDNA序列,应用DNAMAN、NCBI ORF finder、BLAST、Conserved Domains、GOR、SWISS-MODEL、PDB等基因和蛋白质分析软件进行该目标基因测序及氨基酸序列分析。结果赤子爱胜蚓PP2A类似激活剂样蛋白cDNA序列长547 bp,编码87个氨基酸残基;与该蛋白基因序列相似度较高的多是不同物种中PP2A类似激活剂蛋白基因序列,其中与Crassostrea virginica serine/threonine-protein phosphatase 2A activator-like mRNA核苷酸相似度为67%;与该蛋白氨基酸序列相似度较高的多是不同物种中的PP2A类似激活剂蛋白氨基酸序列,其中与serine/threonine-protein phosphatase 2A activator(Crassostrea gigas)氨基酸相似度为70%;目标序列中存在一段PTPA超家族保守结构域,蛋白质二级结构以α螺旋以及无规则卷曲为主,三级预测结果与二级结构一致。结论本实验分析的赤子爱胜蚓PP2A类似激活剂样蛋白与牡蛎PP2A类似激活剂蛋白及存在于所有真核生物中且高度保守的PTPA同源度较高,可能具有特异性激活肿瘤抑制因子PP2A的间接抑制肿瘤作用。

关键词(KeyWords): 赤子爱胜蚓;蛋白磷酸酶2A;类似激活物样蛋白;cDNA;氨基酸;序列分析

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 国家自然科学基金资助项目(30472251);; 山西省重点研发计划(指南)项目(201703D421023)

作者(Author): 马培元;于保锋;王萱;张丽娜;田九博;穆秀丽;孟涛涛;弓韬;

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DOI: 10.13200/j.cnki.cjb.003004

参考文献(References):

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