中国生物制品学杂志

2017, v.30(01) 53-58

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2015年山东省烟台地区柯萨奇病毒A组16型VP1区基因特征分析
Genetic characteristics Coxsackievirus A16 VP1 in Yantai Region,Shandong Province, China in 2015

孙振璐;张桂芳;宫连凤;刘娟;王成芳;王志昱;高巧;

摘要(Abstract):

目的研究2015年山东省烟台地区手足口病(hand,foot,and mouth disease,HFMD)的病原谱,并分析病原谱中柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus A16,CV-A16)流行株的进化及VP1区重要氨基酸位点的变异情况。方法采用实时荧光逆转录聚合酶链反应方法,对2015年烟台地区采集于HFMD患者的696份样品进行肠道病毒(enterovirus,EV)核酸检测和分子定型。根据EV的优势血清型,选取10株CV-A16扩增VP1区,并进行核苷酸序列及系统发育分析。结果从696份标本中检出EV 412株,其中101株为CV-A16,76株为EV-A71型。10株CV-A16的核苷酸序列相似性为88.4%~99.9%,氨基酸序列相似性为98.6%~100%。10株CV-A16烟台株分别属于B基因型的B1a和B1b进化分支,其中B1b进化分支为优势株。与参考株Tainan/5079/98(AF177911)相比,10株CVA16分离株氨基酸序列的第11、23、99、145、289位氨基酸出现突变,10株分离株的这些位点也有不同,表明烟台地区的CV-A16有其独特的突变位点。结论 CV-A16是引起2015年烟台地区HFMD发病的常见病原体,本次分离到的CV-A16均属于B基因型的Bla和B1b进化分支。

关键词(KeyWords): 手足口病;柯萨奇病毒A组16型;系统发育

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 烟台市科技发展计划项目(2012114)

作者(Author): 孙振璐;张桂芳;宫连凤;刘娟;王成芳;王志昱;高巧;

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